红花转录物组中筛选的Unigene100791基因克隆、生物信息学分析及功能预测

作者：陈笑; 沈彦岐; 王清曼; 杜林娜; 卢玉彬; **东; 郭咏昕; 王红雨; 杨莹; 杨晶; 魏健

来源：食品工业科技, 2016, (23): 145-149+155.

DOI：10.13386/j.issn1002-0306.2016.23.019

• 红花
• 转录因子
• Dof
• 克隆
• 生物信息学 Safflower
• transcription factor
• Dof
• cloning
• bioinformatic

目的:克隆红花Unigene100791基因,研究其表达情况;并对该基因的特性进行生物信息学分析,为后续红花代谢调控及提高红花油产量,使其满足食品工业市场需求奠定理论基础。方法:从红花转录物组数据库中筛选得到转录因子Dof相关基因Unigene100791的中间片段;利用RNAiso plus试剂法提取红花种子总RNA,利用RT-PCR方法反转录得到红花种子c DNA;采用3'Race方法从红花种子中克隆Unigene100791基因的全长序列;通过生物信息学方法对其全长基因进行分析,构建该基因与相关物种的系统进化树,研究其蛋白序列的同源性及其理化性质与结构特征,预测其生物学功能。结果:成功克...

• 单位
  吉林农业大学; 长春师范大学