特发性扩张型心肌病心衰相关基因和miRNA的筛选与分析

作者：孙豪杰; 王杨淦^*

来源：重庆医科大学学报, 2022, 47(01): 85-91.

DOI：10.13406/j.cnki.cyxb.002797

• 特发性扩张型心肌病
• 心衰
• 差异表达基因
• miRNA

目的:筛选特发性扩张型心肌病(idiopathic dilated cardiomyopathy,IDCM)心衰发展过程中潜在的关键基因和miRNA。方法:纳入GEO数据库中2个基因表达谱芯片,消除数据之间的批次效应并进行标准化后,筛选出共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),然后进行基因本体(gene ontology,GO)分析和KEGG富集分析,利用STRING构建蛋白质互作网络,利用miRNet获得靶向DEGs的miRNA,构建miRNA-DEGs网络,并用Cytoscape分析关键基因和miRNA。结果:根据|logFC|>0.4,P<0.05筛选出DEGs共210个,主要富集在PI3K信号通路、MAPK信号通路及与肿瘤相关的通路等。筛选出关键基因STAT3、MYC和CCND1等,以及关键miRNAs如miR-34a-5p、miR-17-5p和miR-20a-5p。结论:基于生物信息学方法对特发性扩张型心肌病心衰发展过程中潜在的关键基因和miRNA进行了筛选与分析,共筛选出210个差异基因及7个功能模块,分析了3个关键miRNAs,为进一步研究IDCM心衰的发生机制和治疗靶点提供思路。

• 单位
  武汉大学中南医院