摘要
喀西茄(Solanum aculeatissimum)具有药用价值和园林观赏价值,目前国内外对喀西茄香味表达的相关研究以及开发利用较少,主要集中在其药用价值和栽培技术。本研究以云南省昆明市野生种喀西茄果实为试材,研究喀西茄不同生长发育阶段香味表达的差异性,以表型差异明显的两个不同成熟阶段喀西茄果实“绿熟期”和“黄熟期”为材料,探究影响果实香味合成的关键基因。基于高通量测序技术平台Illumina进行转录组测序,结果共获得54 337条单基因簇(unigene)。将获得的unigenes与非冗余蛋白数据库、基因本体数据库、东京基因与基因组数据库等数据库进行比对,结果显示:分别有28 610、22 805、3 599条unigenes成功获得注释。“绿熟期”与“黄熟期”对比有514个上调DEGs和1 151个下调DEGs。GO富集分析发现,DEGs主要富集在细胞、细胞组分等生物过程。利用实时荧光定量PCR对DEGs进行表达模式验证,发现其与RNA-Seq测序结果一致,证实了测序结果的准确性。研究结果丰富了喀西茄的转录组序列资源,初步获得调控果实香味的候选因子,为进一步开展基因功能提供了理论支持。
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