摘要
目的探索DNA甲基化是否为BMI和胰岛素-妊娠期糖尿病(insulin-treated gestational diabetes mellitus, I-GDM)之间的中介变量,并估计其中介效应。方法研究资料来自基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO),检索号为GSE88929,由产科医生收集44例I-GDM病例和64例对照,共纳入212 991个胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤双核苷酸(cytosine-phosphate-guanine pairs of nucleotides, CpG)位点。采用因果推断检验(causal inference test, CIT)筛选出潜在的中介CpG位点。调整孕龄、胎儿性别和胎龄三个混杂因素,进一步通过CpG位点估计BMI对I-GDM的中介效应。结果 CIT过程第一步结果表明BMI与I-GDM有关联(OR=1.057, 95%CI:1.014~1.105,P=0.010);第二步调整BMI,采用伪发现率(false discorery rate, FDR)方法进行多重检验校正,共筛选出与I-GDM相关联的6 348个CpG位点纳入下一步分析;第三步调整I-GDM后,确定529个CpG位点分别与BMI有关联;第四步分别调整6个CpG位点后,BMI与I-GDM相互独立。因此,CIT检验出6个CpG位点(cg00542041、cg08589721、cg25775742、cg15819225、cg26824326、cg15110463)作为BMI与I-GDM的中介变量。进一步采用中介分析因果推断模型,证实上述6个CpG存在中介效应。结论本研究发现6个DNA甲基化CpG位点在BMI和I-GDM之间发挥了中介作用,均可能作为I-GDM发病机制中新的生物标记物,为研究BMI和I-GDM之间复杂的生物学机制提供了参考依据。
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