基于SLAF-seq技术的思茅松SNP位点开发

作者：王玉昌; 彭劲谕; 蔡年辉; 段安安; 杨利华^*; 王大玮^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(12): 3957-3963.

DOI：10.13271/j.mpb.021.003957

• 思茅松
• SLAF-seq
• 高通量测序
• SNP位点

为开发大量的思茅松SNP标记，本研究以思茅松两亲本和100个杂交的Fl代遗传群体为研究对象，利用SLAF-seq测序技术进行测序。选择HaeⅢ酶进行酶切，长度在414～464 bp的酶切片段定义为SLAF标签，然后将每个样本和标签序列比对，以获得不同样本的SNP标记信息。结果表明，建库双端比对效率在84.91%，酶切效率为95.52%,SLAF建库正常。共获得507 394 471个数据，测序平均Q30为92.25%,GC含量为40.23%，分布正常。共获得633 086个SLAF标签，其中多态性SLAF标签有239 790个，共有140 485个标签成功编码，共开发获得11 544个SNP标记。本研究结果可以对思茅松优良基因实行精细定位，为优良性状筛选、种质资源的鉴定和群体进化等相关研究提供新的依据。

• 单位
  西南林业大学