红光对京海黄鸡卵巢转录组模式调控分析

作者:王莹; 李婉晴; 贺文庆; 王金玉*
来源:中国畜牧杂志, 2023, 59(12): 205-211.
DOI:10.19556/j.0258-7033.20221103-05

摘要

本研究通过分析不同光色条件下京海黄鸡卵巢转录表达谱,筛选出与光色影响卵泡发育的相关基因。选择红光(660 nm)和白光(400~760 nm)条件下300日龄京海黄鸡各3只,采集卵巢组织,利用高通量测序,构建红光和白光条件下京海黄鸡的卵巢基因表达谱并进行分析。将测序获得的结果与数据库进行比对,获得40.79G高质量数据,与参考基因组比对率在93.01%以上。利用DESeq软件分析显示,与白光组相比,获得416个DEGs,其中上调和下调的分别279个和137个。GO分析显示DEG显著富集在生物控制类别、细胞过程类别、细胞类别和结合功能类别亚类中所占比例最高。KEGG分析显示,DEG显著富集到GnRH信号通路、Wnt信号通路、钙离子信号通路、细胞粘黏分子通路、细胞因子与细胞因子受体相互作用通路等信号通路。利用qRT-PCR对随机挑选的8个差异基因进行验证,结果与测序结果一致。通过构建PPI蛋白互作网络关系,进一步筛选出FGF7、IGFBP1、PRL、PTK2B和POMC 5个与卵泡发育相关的候选基因,为进一步阐明红光影响京海黄鸡产蛋性能的分子作用机制提供了重要基础。

全文