幽门螺杆菌基因组DNA芯片的研制

作者：韩跃华; 刘文忠; 史耀舟; 卢莉琼; 萧树东; 赵国屏

来源：中国人兽共患病学报, 2007, (03): 244-247.

• 幽门螺杆菌
• 基因组DNA芯片
• 研制 Helicobacter pylori
• genome DNA microarray
• preparation

目的研制幽门螺杆菌(H.pylori)基因组DNA芯片。方法以H.pylori26695和J99作为模板,利用多聚酶链反应(PCR)扩增得到所需要的开放阅读框(open reading frame,ORF)片段。使用Genemachine点样仪进行点样,采用Cy3-dCTP或Cy5-dCTP以及Klenow片段标记H.pylori基因组DNA,并完成芯片杂交和数据读取。数据判断标准是标化后Cy3/Cy5比值(ratio)<0.5则认为不存在这一基因(记作0),若ratio值≥0.5则认为存在这一基因(记作1)。使用芯片重复性、信噪比以及假阳性率和假阴性率评估芯片质量。结果研制的H.pylori...

• 单位
  浙江大学医学院附属第二医院; 上海交通大学医学院附属仁济医院; 生物芯片上海国家工程研究中心