猪PCK1基因SNPs检测及其与生长育肥性状的关联分析

作者：展西振; 刘军; 彭雅鑫; 秦亮; 吕威; 阮兴友; 左波^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(11): 106-118.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20221005-01

• PCK1
• 猪
• SNP
• 生长育肥
• 关联分析

本实验旨在研究猪磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1(Phosphoenolpyruvate Carboxykinase 1,PCK1)基因SNPs及其与生长育肥性状之间的关系，为猪育种提供新的标记资源。本研究以美系大白猪为研究对象，采用直接测序的方法检测PCK1基因内部的多态性位点，并与生长育肥性状进行关联分析。结果发现在美系大白猪中共检测到PCK1基因11个SNPs，关联分析结果显示，PCK1基因多态性位点rs713611695与初生重、达100 kg体重日龄极显著相关，与眼肌面积显著相关；多态性位点rs324442589与达100 kg体重日龄和体长性状显著相关、与眼肌面积极显著关联；多态性位点rs699149356与活体背膘厚极显著相关；多态性位点rs321585061与初生重极显著关联；多态性位点rs331839879与初生重极显著关联、与左乳头数显著关联；多态性位点rs335103760与初生重和眼肌面积极显著关联；多态性位点rs341303544与初生重极显著关联、与体长显著关联。连锁不平衡分析结果显示，多态性位点rs321585061与rs702046790、rs321585061与rs335103760、rs702046790与rs335103760、rs331839879与rs323291342、rs713611695与rs323291342、rs713611695与rs331839879处于强连锁不平衡（D’>0.8,r2>0.33）。单倍型组合分析发现，单倍型组合H2-H5、H3-H3达100kg体重日龄极显著高于H1-H1、H1-H2、H1-H3、H2-H4；单倍型组合H1-H3、H1-H4、H3-H3活体背膘厚性状极显著高于H3-H4；单倍型组合H2-H5初生重极显著高于H2-H2；单倍型组合H1-H2、H1-H3、H2-H3眼肌面积极显著高于H2-H5；单倍型组合H1-H3体长极显著高于H3-H3,H1-H3是改良猪眼肌面积和体长性状的优势单倍型组合。以上结果表明PCK1基因可以作为猪遗传改良的候选基因，也为深入研究该基因功能提供了一定的参考。

• 单位
  动物科技学院; 华中农业大学