区域补偿政策是改善跨区域河流治理困难的有效手段,而监测的合理性是补偿的关键因素。文章以南京市秦淮区为例,针对监测过程中手工监测误差、恶劣天气影响、闸泵管控、合流河道认定等监测问题进行了优化研究,提出了相应的改善措施,有助于水环境区域补偿制度的有效实施。