基于TCGA数据库分析VEGFA在结肠癌中的表达及薏苡仁的干预研究

作者：李周瑜; 杨欣^*; 张迎; 石昌菊; 金继华

来源：中医药信息, 2022, 39(10): 28-34.

DOI：10.19656/j.cnki.1002-2406.20221005

• 结肠癌
• VEGFA
• 预后
• 网络药理学
• 薏苡仁

目的：基于TCGA分析筛选出的关键基因mRNA在结肠癌组织中的表达并探讨薏苡仁对其干预作用。方法：基于TCGA数据库分析TP53、MYC、VEGFA、JUN、MMP9、TNF和EGFR基因在结肠癌患者中的表达状态；采用GEPIA数据库对TP53、MYC、VEGFA、EGFR、MMP9、JUN基因进行Kaplan-Meier生存分析和Log-rank P检验；选择与结肠癌预后相关的基因VEGFA和EGFR探讨其与临床分期和多种临床病理特征的关系；采用Cox比例风险回归模型对与临床病理相关的基因VEGFA进行单因素和多因素分析，分子对接技术分析薏苡仁与VEGFA的结合情况。结果：共筛选出174个结肠癌的靶标基因，TP53、MYC、VEGFA、JUN、MMP9、TNF和EGFR为核心基因。TCGA数据库中筛选出473例结肠癌样品和41例癌旁样品，TP53、MYC、VEGFA、JUN、MMP9和EGFR mRNA表达值在结肠癌和癌旁组织中差异具有统计学意义（P≤0.01）。VEGFA、EGFR基因表达量与COAD预后的差异具有统计学意义（P <0.05）;VEGFA表达量与N分期呈正相关（P <0.05）；单因素分析发现，年龄、临床分期及T、N、M分期能够影响结肠癌患者的预后（P <0.05）;COX多因素回归分析结果提示，年龄、T分期是影响结肠癌患者预后的独立因素（P <0.05）。通过分子对接分析发现，薏苡仁中16个化学成分与VEGFA有较好的结合（T＿Score> 5）。结论：VEGFA与结肠癌发生、发展和预后关系密切，薏苡仁对其具有干预作用。

• 单位
  贵州中医药大学; 基础医学院