基于TCGA数据库探究膀胱癌关键基因的表达及预后作用

作者：马涛; 陶润; 关翰; 张家俊^*

来源：蚌埠医学院学报, 2022, 47(06): 811-817.

DOI：10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2022.06.027

• 膀胱肿瘤
• TCGA数据库
• 基因
• 差异化表达

目的：探究膀胱癌(BC)中基因的差异化表达及其预后作用。方法：从TCGA数据库中下载BC的基因表达数据，利用R软件筛选出肿瘤与正常组织间差异表达基因，并进行富集分析，评估其潜在生物学功能及信号通路。利用在线数据库STRING11.0构建了编码蛋白相互作用网络，进一步筛选关键基因。通过UALCAN、GEPIA数据库验证关键基因在BLCA中的表达水平。随后利用在线工具Kaplan Meier Plotter分析他们的预后情况。结果：得到1 538个基因存在差异表达，其中有1 088个上调，450个下调，富集分析发现差异基因主要与信号转导、物质代谢、免疫反应等信号通路相关。10个关键基因中，在BC中白细胞介素-6表达越高预后越好(HR=0.46,P<0.05),间皮素表达越高预后越差(HR=2.27,P<0.05)。结论：BC中存在众多差异表达的基因，他们对疾病进展存在影响，发现并利用他们在BC个体化治疗存在重要意义。

• 单位
  蚌埠医学院第一附属医院