新型冠状病毒肺炎疫情暴发,使城市公共交通系统的疫情防控面临严峻考验。城市轨道交通作为城市公共交通骨干力量,是城市公共交通系统疫情防控的重要环节之一,面临着工作任务重、压力大的挑战。结合新型冠状病毒肺炎疫情防控对城市轨道交通产生的影响,总结了武汉地铁停运阶段及恢复运营初期所面临的挑战,分析了不同阶段的客运管理措施,并针对目前客运管理措施中的不足提出改善建议。