沙柳SpsNAC005基因克隆及生物信息学分析

作者：杨海峰; 于兴旺; 金娜; 贺玉娇; 李安玉; 张鑫; 王英姿; 高羽翼; 王雷^*

来源：内蒙古农业大学学报(自然科学版), 2021, 42(05): 65-71.

DOI：10.16853/j.cnki.1009-3575.2021.05.010

• 沙柳
• NAC基因
• 生物信息学

本研究以沙柳为材料,基于毛果杨、欧洲红皮柳的序列,采用同源克隆的方法获得沙柳SpsNAC005基因,利用生物信息学软件分析SpsNAC005基因序列、构建进化树、预测蛋白结构。结果显示,SpsNAC005基因的开放阅读框序列长度为927 bp,编码为308个氨基酸。生物信息学分析表明,SpsNAC005含有NAC基因家族的典型NAM结构域,具有A、B、C、D、E 5个保守亚结构域。SpsNAC005基因为亲水性蛋白,预测细胞定位在细胞核上,其可能作为转录激活因子在细胞核中行使功能。本研究为进一步探索NAC基因在沙柳抗逆胁迫调控中的机制研究提供了重要的科学依据。

• 单位
  内蒙古农业大学