猪流产胎儿中猪圆环病毒3型的检测及其遗传演化分析

作者：何庆; 李周勉; 王欢; 李丹彤; 谭庆辉; 邹亚文; 苏建明; 邓治邦; 杨毅; 王乃东^*

来源：畜牧兽医学报, 2022, 53(05): 1527-1535.

• 猪圆环病毒3型
• 全基因组
• Cap
• 遗传演化分析

旨在分析猪流产胎儿中猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)的感染及其遗传进化情况。对2015—2017年采集的湖南省680份猪流产胎儿病料样品进行PCV3检测、扩增和测序，并利用生物信息学软件对获得的序列进行遗传进化分析。结果显示，猪流产胎儿样品中PCV3阳性率为24.4%(166/680),其中，2015—2017年阳性率分别为18.2%(26/143)、22.7%(54/238)和28.8%(86/299)。从PCV3阳性样本中获得了1株PCV3基因组全长序列，命名为PCV3/CN/Hunan-57(GenBank序列登录号为MZ934695),与国内外毒株基因组序列相比，相似性为97.8%～99.2%;获得了5株PCV3 ORF2基因序列，它们的核苷酸和氨基酸相似性为97.5%～98.3%和96.7%～99.7%,与国内外参考毒株ORF2基因序列相比，其核苷酸和氨基酸相似性为96.3%～99.2%和96.8%～100%。基于ORF2基因序列构建遗传进化树和进行多重序列比对，发现获得的PCV3阳性序列分别属于PCV3a(1株)和PCV3c(4株),并鉴定出T100A、G113S和A184S突变位点。综上表明，猪流产胎儿中PCV3感染率较高，且存在不同类型的PCV3毒株感染，为后续深入研究PCV3遗传变异及其相关致病性提供了重要参考信息。

• 单位
  湖南农业大学