长链非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的表达及功能分析

作者：何亚丽; 毛玉娟; 申进增; 伊琳; 顾远辉^*

来源：中国临床药理学杂志, 2021, 37(10): 1209-1213.

DOI：10.13699/j.cnki.1001-6821.2021.10.019

• 长链非编码RNA
• 甲状腺乳头状癌
• 高通量测序
• 实时荧光定量-PCR
• 竞争性内源RNA

目的分析甲状腺乳头状癌(PTC)中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达谱并预测其靶基因。方法用转录组测序技术对PTC及配对的甲状腺癌旁组织测序,以差异倍数(FC)作为标准筛选差异表达基因,并通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行靶基因及相关信号通路的分析,以实时荧光定量-PCR法验证筛选的目的lncRNA。结果共筛选出差异表达的lncRNA 111个(P<0.05);差异表达的mRNA 29个(P<0.05),其中差异显著的lncRNA有18个,上调5个,下调13个(P<0.05)。差异表达靶基因主要参与维生素代谢、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)活性的激活和自噬等生物学过程。差异表达靶基因主要与以下几种传导途径相关:"焦粘连""cAMP信号通路""oxylocin信号通路"和"Wnt信号通路"。lnc01089-006和MSTRG.277779.1在甲状腺乳头状癌TPC-1细胞中表达下调。结论 lnc01089-006和MSTRG.277779.1及其靶基因以及相关信号通路与甲状腺乳头状癌密切相关。

• 单位
  甘肃中医药大学; 甘肃省人民医院