谷子SiPRR73基因在不同光温组合条件下的可变剪切分析

作者：王晓蒙; 李剑峰; 刘辉; 王永芳; 张小梅; 王振山; 桑璐曼; 闫留延; 龚珂珂; 李兴杰; 董志平; 贾小平^*

来源：江西农业大学学报, 2023, 45(06): 1324-1330.

DOI：10.13836/j.jjau.2023122

• 谷子
• PRR73
• 光温互作
• 可变剪切

【目的】通过系统的可变剪切分析揭示SiPRR73参与谷子光温互作调控的可能机制。【方法】利用RT-PCR技术从“延谷11号”克隆生物钟基因SiPRR73，克隆低温（15℃）条件、自然条件、4个光温组合条件下的SiPRR73基因序列进行可变剪切分析。【结果】扩增片段经克隆、测序以及序列拼接后得到2 928 bp的cDNA序列，包含2283 bp的CDS区域，编码760个氨基酸。可变剪切分析表明只有低温（15℃）和低温长日照（22℃、15 h光/9 h暗）条件下检测到的SiPRR73-1和SiPRR73-3剪切体具有完整的编码区，因而具有完整的REC和CCT结构域；自然条件和低温短日照（22℃、9 h光/15 h暗）条件检测到的SiPRR73-2、SiPRR73-4剪切体均缺失CCT结构域；高温（27℃）条件无论长日照还是短日照SiPRR73均形成缺失REC和CCT结构域的SiPRR73-5、SiPRR73-6两种剪切体。【结论】SiPRR73基因通过可变剪接的方式参与谷子的光温互作调节。

• 单位
  河南科技大学; 河北省农林科学院谷子研究所