不同竹龄毛竹茎干内生细菌多样性与功能预测

作者:朱伟垚; 林梦婷; 吴仲义; 许晓晨; 赵文宝; 宋漳; 张清华*
来源:四川农业大学学报, 2022, 40(05): 766-774.
DOI:10.16036/j.issn.1000-2650.202112082

摘要

【目的】研究不同竹龄的毛竹茎干内生细菌群落结构与生物学功能。【方法】对采集于同一竹林的1~5 a生毛竹茎干内生细菌进行高通量测序及生物信息分析。【结果】所有样本共检测到细菌21个门和337个属,α多样性指数显示,1 a生毛竹内生细菌多样性最低,Simpson和Shannon指数仅为0.42和1.75;2~5 a生毛竹茎干内生菌种群Simpson指数都超过0.93,种类多样性高,其中,4 a生茎干内生细菌Shannon指数最高,为7.01,显著高于其他竹龄。1 a生毛竹茎干中优势属为欧文氏菌属(Erwinia),2 a生毛竹茎干中优势属苍白杆菌属(Ochrobactrum)、链球菌属(Streptococcus)及根瘤菌科多个属(Genus of Rhizobiaceae),3 a生毛竹内生细菌优势菌属为苍白杆菌属和根瘤菌科的多个属,4 a生毛竹内生细菌优势菌属为苍白杆菌属和梭菌属(Clostridium),5 a生毛竹茎干内生细菌优势菌属为欧文氏菌属、梭菌属和泛菌属(Pantoea),表明不同年龄毛竹其茎干部位内生细菌组成有明显差异。功能预测结果显示,各样本功能主要在碳水化合物降解方面,并且在外源生物降解与代谢、其他氨基酸的代谢和脂质代谢方面1 a生与5 a生样本有明显下降趋势。【结论】研究结果解析了不同竹龄毛竹内生细菌的种群多样性和变化规律,对于解析毛竹与内生菌的相互作用具有参考价值。

全文