绵羊CARTPT基因的生物信息学分析

作者：邵顺成; 闫背背; 张稳; 张天闻; 梁鹏; 邹诗凡; 冯登侦^*

来源：现代畜牧兽医, 2020, (11): 1-5.

• 绵羊
• CARTPT基因
• 生物信息

试验旨在探究绵羊CARTPT基因所编码蛋白的结构与功能,利用生物信息学软件研究其理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜区域、蛋白质二级结构与三级结构、亚细胞定位和蛋白结构域、糖基化和磷酸化位点,并构建不同物种的CARTPT基因的系统发育树。结果表明:绵羊CARTPT基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量12 790.18 Da,理论等电点8.22,脂肪系数114.48,总平均亲水性-0.006,属于分泌蛋白,没有跨膜区域结构;二级结构中主要以α-螺旋与无规则卷曲为主;亚细胞定位分析预测该蛋白最可能在细胞外基质发挥其生物学作用,有1个跨膜结构域;该蛋白质有5个丝氨酸(Ser)、1个苏氨酸(Thr)、2个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;系统进化树发现绵羊与山羊亲缘关系最近。

• 单位
  宁夏大学