为解决“山西教案”,以李提摩太为首的教会代表要求在山西创建学堂。为维护教育主权,山西地方当局决定抢先成立山西大学堂。几经博弈,李提摩太同意将筹建的中西大学堂改为西学专斋,由此形成山西大学堂“一校两制”的办学格局。在行政权力安排、学生招生与管理、课程与教学等方面,西学专斋享有高度的自治权,迥异于同校的中学专斋。山西大学堂的创建过程是特殊历史背景下清廷、山西地方当局、教会共同参与博弈的结果。