木薯ERF转录因子调控的靶基因筛选与表达分析

作者:宋娜; 张刘宁颖; 曹敏; 郭文雅; 洪雨慧; 吴金山; 陈银华; 于晓惠*
来源:热带生物学报, 2020, 11(02): 177-189.
DOI:10.15886/j.cnki.rdswxb.2020.02.008

摘要

为解析乙烯响应因子(ERF, Ethylene Response Factor)在木薯(Manihot esculenta)生长发育过程中的调控通路,本研究从木薯全基因组数据库中,筛选出启动子区含有GCC-box顺式作用元件的基因204个,利用生物信息学手段对这些基因进行染色体位置分布分析、病原菌侵染下表达模式分析以及启动子结构预测,部分候选基因的qRT-PCR结果表明:Manes.02G189600, Manes.03G039700, Manes.06G002000, Manes.09G063700,Manes.14G141600,Manes.15G181900可能参与调控植物的抗病途径,同时在乙烯介导的信号传递途径中也起重要作用。

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