安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区序列分析

作者：陈红莲; 王永杰; 蒋业林; 程云生; 张静; 王芬

来源：安徽农业大学学报, 2017, 44(05): 784-789.

DOI：10.13610/j.cnki.1672-352x.20171017.002

• 克氏原螯虾
• 白斑综合征病毒
• ORF94
• ORF75
• ORF125
• 序列分析

白斑综合征已给安徽省克氏原螯虾产业带来了巨大的经济损失。为了解安徽省白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)分子流行病学,2016年4—8月在安徽省6个市采集9个养殖的克氏原螯虾样本进行WSSV套式PCR检测,扩增病毒可变区ORF94、ORF75和ORF125,将获得序列进行比较分析。结果显示,9个样本均在第1轮PCR扩增中获得阳性结果,其ORF94的重复单元(repeat unit,RU)数量为2、4、7、8和12,2RUs为常见基因型,ORF75的组合RUs总数为3、6、9、10和11,9 RUs为常见基因型,排列顺序为45、102、45、102、3×45、102和45,ORF125的RUs为59,其中7 RUs和6 RUs为常见基因型。

• 单位
  安徽省农业科学院水产研究所