激光捕获显微切割纯化的人结肠癌组织的定量蛋白质组学研究

作者：李国庆; 李园园; 李茂玉; 梁旭俊; 肖哲锋; 邵美英; 彭芳; 张鹏飞; 陈永恒; 陈主初

来源：基因组学与应用生物学, 2017, 36(08): 3358-3367.

DOI：10.13417/j.gab.036.003358

• 结肠癌
• 生物标志物
• 激光捕获显微切割技术
• 同位素标记相对和绝对定量

为分析结肠上皮癌变进程中的差异表达蛋白质,筛选结肠癌诊断候选标志物,先采用激光捕获显微切割技术(LCM)纯化人正常结肠组织和结肠癌组织,再采用同位素标记对蛋白质进行相对和绝对定量(i TRAQ),然后结合强阳离子柱分离和反相液质联用(2D-LC-MS/MS)鉴定差异表达蛋白质。试验共鉴定了1 042个非冗余蛋白,筛选出与人结肠癌变相关的差异蛋白162个,其中在结肠癌中表达上调的蛋白质68个,表达下调的蛋白质94个,功能分析表明,这些差异蛋白质涉及内质网蛋白质加工、糖酵解/糖原异生、黏着斑细胞连接、调节微丝组装和细胞外基质受体相互作用等分子功能。进一步采用Western blotting及免疫组织化学技术(IHC)验证了其中差异蛋白S100A9的表达,证实了定量蛋白质组学结果的可靠性。研究表明:差异表达蛋白质与结肠癌变相关,并有可能成为结肠癌诊断的候选分子标志物,为进一步深入研究这些蛋白质在结肠癌发生和发展进程中的分子机制,为结肠癌的发病机制研究提供新线索。

• 单位
  中南大学湘雅医院; 广西科技大学; 南华大学