荸荠CCoAOMT基因的克隆与表达分析

作者：陈夏鑫; 陈振林; 帅良; 段振华; 商飞飞; 宋慕波^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(20): 6685-6691.

DOI：10.13271/j.mpb.018.006685

• 荸荠(Eleocharis dulcis)
• CCoAOMT基因
• 基因克隆
• 生物信息学分析
• 表达分析

咖啡酰辅酶-A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是植物木质素合成的关键酶之一。为探明CCoAOMT在荸荠木质素单体合成过程中的作用,本研究利用RACE技术在荸荠球茎中克隆CCoAOMT基因的全长序列,并对其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达进行分析。结果表明,克隆得到荸荠CCoAOMT基因cDNA全长1 302 bp,将此基因命名为CwCCoAOMT,其GenBank登录号为MG719240。该序列包含一个786 bp的最大开放阅读框,可编码261个氨基酸,其DNA中包含4个内含子和5个外显子。该蛋白的分子量为29.17kD,理论等点为5.21。CCoAOMT蛋白二级结构中α-螺旋占37.55%,无规则卷曲占35.63%,延伸链占19.16%,β-折叠结构占7.66%。序列比对和系统进化树分析表明,Cw CCoAOMT蛋白与其它植物CCoAOMT蛋白序列相似度较高,其中与慈竹的亲缘关系最近。通过各组织表达特性分析发现,CwCCoAOMT在荸荠皮中的表达最高,在荸荠肉中的表达最低。在鲜切荸荠贮藏过程中CwCCoAOMT的表达呈快速上升趋势,而水杨酸处理能显著抑制CwCCoAOMT表达上升。本实验结果可为控制鲜切荸荠黄化的研究提供理论依据。

• 单位
  大连工业大学; 贺州学院