泰州鹅开产前后肝脏组织转录组对比分析

作者：张蕾; 章敬旗; 章玮月; 糜娟; 何文杰; 王健^*

来源：福建农业学报, 2020, 35(09): 987-996.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2020.09.010

• 转录组测序
• 泰州鹅
• 肝脏
• 开产

【目的】进一步完善泰州鹅基因组结构信息,探索泰州鹅开产前、后肝脏的调控机制。【方法】利用RNA-Seq技术对开产前、后泰州鹅肝脏组织转录组进行分析,利用qRT-PCR对部分RNA-Seq数据进行验证;利用GO富集分析和KEGG通路注释对差异表达基因功能进行解析。【结果】测序获得的初始数据(raw reads)进行系列质控筛选,6个泰州鹅开产前、后肝脏组织获得73 596 894～79 837 756个高质量数据(clean reads),结合FPKM值定量估计所检测的基因表达值,筛选出202个差异基因,其中上调差异表达基因100个,下调差异表达基因102个,经GO功能注释后富集到42个生物功能类别;KEGG分析筛选到63条差异信号通路,其中5条显著富集信号通路为药物代谢-细胞色素P450、氮代谢、戊糖和葡萄糖醛酸相互转化、视黄醇代谢、类固醇激素生物合成通路,这些信号通路功能分析显示与脂质代谢以及生殖过程密切相关。【结论】开产前后泰州鹅肝脏组织RNASeq分析表明,泰州鹅开产前后肝脏组织中的差异基因多集中于脂质代谢以及生殖过程,研究结果为进一步研究泰州鹅开产期的肝脏调控机制以及加速泰州鹅地方种群的进一步选育提供了新的数据支撑。

• 单位
  江苏农牧科技职业学院