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摘要
维甲酸X受体(retinoid X receptor, RXR)属于配体激活的核受体家族。本研究采用RT-qPCR技术克隆了曼氏无针乌贼RXR (SjRXR)基因的CDS区核酸序列,推导出其氨基酸序列,并对RXR基因CDS区核苷酸序列与蛋白质结构进行了生物信息学分析,结果如下:SjRXR的CDS区核苷酸序列全长1239 bp,编码1个由412个氨基酸组成的蛋白质;序列分析表明,曼氏无针乌贼RXR的CDS区基因编码的蛋白质不含有信号肽,无跨膜结构,推测RXR编码蛋白属于非分泌型、非跨膜蛋白;对蛋白进行疏水性分析,发现亲水性部分大于疏水性部分,预测RXR编码蛋白为亲水性蛋白,包含1个HOLl家族的结构域;利用MEGA 6.0软件以ML法构建了系统进化树,结果表明,曼氏无针乌贼与双斑蛸亲缘关系最近,同属于软体动物门头足纲,最先聚为一支,曼氏无针乌贼RXR基因的分子进化地位与其生物学分类地位大体保持一致。采用RT-qPCR技术分析了该基因在乌贼4个时期11个组织中的表达规律,结果如下:sjRXR基因在各组织中均有表达,且在肝、胰、脑、视叶和视腺中表达量较高; sjRXR基因表达在不同生长周期存在明显变化,在肝、胰中呈一直上升趋势,在脑、视叶、视腺中呈先上升后下降趋势。SjRXR是曼氏无针乌贼神经发育、生殖调节和衰老凋亡的重要调控因子之一,本研究结果可为进一步深入研究头足类动物RXR基因提供重要参考依据。
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单位浙江海洋大学; 浙江省海洋水产研究所
