油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析

作者：周丽霞; 赵志浩; 杨蒙迪; 曹红星; 杨耀东^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(17): 5637-5648.

DOI：10.13271/j.mpb.020.005637

• 油棕
• TCP转录因子
• 全基因组鉴定
• 表达分析

TCP基因作为植物所特有的转录因子家族，广泛参与调控植物的生长发育、代谢、信号转导、生理生化刺激响应及逆境应答等多个生物学过程。本研究利用生物信息学研究方法鉴定获得28个油棕TCP基因家族成员，并对其染色体定位、结构特点、motif、聚类分析及组织表达特异性进行分析。结果表明：共有27个基因在油棕的14条染色体上呈不均匀分布；EgTCP基因的长度均相对较短，其中14个基因只有1个外显子，EgTCP11基因含外显子个数最多(5个)；序列分析表明油棕TCP基因均含有高度保守的bHLH结构域，启动子上存在较多的植物激素响应及逆境应答等顺式作用元件；系统进化分析显示28个油棕TCP蛋白被划分为ClassⅠ(13个蛋白)和ClassⅡ(15个蛋白)两大类，其中ClassⅡ进一步分为CYC/TB1 (4个蛋白)和CIN (11个蛋白)两个亚类；通过表达模式分析发现花中特异表达的TCP基因数量最多(EgTCP05, EgTCP09,EgTCP15, EgTCP27和EgTCP28),EgTCP27基因在中果皮中的表达量逐渐上调，到花后23周时表达量升至最大。本研究为进一步探索油棕TCP基因的生物调控功能提供一定的理论基础。

• 单位
  中国热带农业科学院椰子研究所; 海南省热带油料作物生物学重点实验室