新型鹅呼肠孤病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立

作者:董嘉文; 黄允真; 李林林; 张俊勤; 陈修邓; 张志宏; 李万荣; 邝瑞欢; 孙敏华
来源:中国动物传染病学报, 2022, 1-9.
DOI:10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20220721.002

摘要

2020年以来,在我国养鹅地区出现了一种由新型鹅呼肠孤病毒(NGRV)引起的以肝脾点状白色灶性坏死为主要病变特征的鹅传染性疾病。为了快速有效地检测新型鹅呼肠孤病毒(NGRV),本试验针对禽呼肠孤病毒的λC基因设计引物和探针,建立了基于TaqMan探针荧光定量PCR方法,结果显示:该方法特异性强,对鹅细小病毒、坦布苏病毒、鹅圆环病毒、番鸭呼肠孤病毒、新型鸭呼肠孤病毒和鹅星状病毒等病原不存在交叉反应;该方法具有较高的敏感性,最低可检测限为56.6个拷贝/μL,比常规PCR方法敏感10倍;该方法的重复性良好,组内和组间变异系数小于2%。对37份疑似新型鹅呼肠孤的临床样品检测结果显示,荧光定量RT-PCR和RT-PCR检测出阳性样品均为13份,两者符合率为100%。测序结果表明,13份阳性样品均为新型鹅呼肠孤病毒。本试验成功建立了新型鹅呼肠孤病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法,为新型鹅呼肠孤病毒病的流行病学调查和防控奠定了坚实的基础。

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