在当前"互联网+外贸"的背景下,跨境电商已经成为促进外贸转型的新型贸易形式。跨境电商中的知识产权是迅猛发展的新事物。厘清自贸区和跨境电商的概念是分析自贸区跨境电商形式的首要前提。由于自贸区的跨境电子商务面临着许多知识产权保护的困境,因此,文章以上海自贸区知识产权审判实践为例,旨在为保护自贸区跨境电商知识产权保护提出前瞻性的法律建议。