双功能基因APE1调控人骨肉瘤HOS细胞miRNAs的初步研究

作者：戴楠; 李梦侠; 卿毅; 李崇义; 杨宇馨; 代晓燕; 王东^*

来源：第三军医大学学报, 2014, 36(19): 1976-1980.

DOI：10.16016/j.1000-5404.2014.19.014

• 脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶
• 非编码小RNA
• 生物信息学
• 骨肉瘤

目的比较APE1-konckdown骨肉瘤HOS细胞miRNAs表达谱的差异,初步探讨APE1可能调控的miRNAs及其涉及的功能通路。方法利用Ad5/F35-APE1 siRNA腺病毒敲低骨肉瘤HOS细胞中APE1的表达,采用miRNA芯片检测敲低组和对照组miRNAs表达谱的改变,qRT-PCR验证,并利用生物信息学分析差异miRNAs涉及的功能。结果miRNAs芯片结果显示,APE1敲低组中有32个miRNAs表达显著改变;qRT-PCR验证有13个miRNAs的改变与芯片结果趋势一致,其中7个上调,6个下调;基因聚类分析发现,13个显著变化的miRNAs涉及的靶基因的功能主要定位在细胞内,与蛋白、DNA结合以及转录功能有关,参与调控发育和细胞代谢等生物过程;Pathway分析显示其靶基因主要涉及粘附连接、轴突导向、ECM-受体相互作用、肿瘤通路,以及TGF-β、MAPK、ErbB、Wnt、mTOR及p53等关键的细胞信号通路。结论 APE1能直接影响骨肉瘤细胞miRNAs的表达;生物信息学分析表明APE1通过调控miRNAs可能影响下游靶基因的表达,参与肿瘤发生、细胞生存、增殖、粘附等生物学过程和多个信号通路,与骨肉瘤的发生、发展、侵袭转移密切相关。