sRNASVM——基于SVM方法构建大肠杆菌sRNA预测模型(英文)

作者：王立贵; 应晓敏; 曹源; 查磊; 李伍举

来源：生物物理学报, 2009, (04): 287-293.

• sRNA
• 支持向量集
• 预测

在理解细菌与环境的相互作用方面,细菌sRNA的识别发挥重要作用。文章介绍了一个通过增加训练集中实验证实的sRNA来构建细菌sRNA预测模型的策略,并以大肠杆菌K-12的sRNA预测为例来说明策略的可行性。结果表明,按此策略构建的模型sRNASVM的10倍交叉检验精度达到92.45%,高于目前文献中报道的精度。因此,构建的这一模型将为实验发现sRNA提供较好的生物信息学支持。有关模型和详细结果可以从网站http://ccb.bmi.ac.cn/srnasvm/下载。

• 单位
  军事医学科学院基础医学研究所