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摘要
目的：在铜死亡基因基础上分析骨肉瘤（OS）中铜死亡基因相关亚型鉴定、预后模型构建和免疫浸润的影响。方法：联合TARGET与GEO数据库对OS相关铜死亡基因进行生存分析及预后相关性分析。采用一致性聚类方法将OS分为铜死亡不同亚型。运用SSGSEA对铜死亡分型进行免疫细胞差异分析。设置P value=0.05和q value=0.05，对铜死亡分型的差异基因进行GO及KEGG富集分析。依据Lasso回归分析及交叉验证结果构建预后模型，并进行风险评估分析和运用ROC曲线评估模型预测准确性。结合临床性状构建列线图预测患者生存期，同时进行风险差异分析。对OS样本进行免疫细胞浸润和肿瘤微环境分析。运用R软件“pRRophetic”包对OS样本进行药物敏感性分析。结果：确定FDX1、GLS、DLAT和PDHB为OS预后的高风险基因。对OS样本进行铜死亡分型，可将OS分为两型：CRGclusterA与CRGclusterB，其中CRGclusterA与Th2细胞相关，CRGclusterB与Th1细胞相关。大部分OS铜死亡基因在CRGclusterA中呈高表达。免疫细胞浸润分析结果表明γδ T细胞、静息肥大细胞和静息树突状细胞与风险评分呈正相关，而CD8 T细胞与风险评分呈负相关。药物敏感性分析显示OS对Elesclomol与GW.441756更敏感。结论：本研究识别出CRGclusterA与CRGclusterB两种亚型。鉴定出4个预后高风险基因：FDX1、GLS、DLAT和PDHB，为OS预后评估和免疫治疗候选靶点提供了新见解。
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单位江西省中医院; 江西中医药大学附属医院; 广西中医药大学附属瑞康医院
