基于mtDNA D-loop区和Cyt b基因序列对鹅喉羚南疆亚种遗传多样性与系统进化地位的分析

作者：张永浩; 韦庆浩; 郭丽君; 阿布都热合曼·吐尔逊; 王玉涛^*

来源：野生动物学报, 2022, 43(02): 354-363.

• 鹅喉羚南疆亚种
• mt DNA D-loop区
• Cyt b基因
• 遗传多样性
• 系统进化地位

为进一步明确南疆地区鹅喉羚(Gazella subgutturosa)的遗传分化、遗传多样性水平和系统进化地位，以鹅喉羚南疆亚种(G. s. yarkandensis)为研究对象，运用PCR扩增和测序技术，研究mt DNA D-loop区和mt DNA Cyt b基因的序列特征，利用邻接法构建系统发育树和中介网络关系，以此阐明鹅喉羚南疆亚种的遗传多样性水平和系统进化地位。结果表明:鹅喉羚南疆亚种mt DNA D-loop区序列碱基A、T含量为60.38%，存在23个多态位点，占总位点数的2.90%，其中包括单一多态位点8个，简约性信息位点15个，存在6处插入和缺失，14个个体存在7个单倍型;平均单倍型多样度为0.813，核苷酸多样度为0.008 90，平均核苷酸差异度为7.747。mt DNA Cyt b基因序列碱基A、T含量为58.39%，存在5个多态位点，占总位点数的0.46%，其中包括单一多态位点1个，简约性信息位点4个，14个个体存在4个单倍型;平均单倍型多样度为0.714，核苷酸多样度为0.001 59，平均核苷酸差异度为1.725。以上数据表明鹅喉羚南疆亚种单倍型多样度远高于核苷酸多样度，具有非常丰富的遗传多样性。系统发育分析表明，鹅喉羚南疆亚种与其他亚种出现了明显的遗传分化，聚类于明显不同的进化支。网络关系分析表明，鹅喉羚具有明显的地理分布特征，研究涉及的鹅喉羚南疆亚种的单倍型大多聚于同一进化支，建议在南疆地区设立自然保护区，加强对鹅喉羚栖息地的生态保护，从而提高其生存适应性。

• 单位
  喀什大学