基于TCGA数据库挖掘UBE2C在肾透明细胞癌中的表达及预后意义

作者：苗裔; 曹芳; 李萍萍; 李娟; 刘洁; 周灿^*; 刘培军

来源：现代肿瘤医学, 2018, 26(24): 3897-3902.

• UBE2C
• 肾透明细胞癌
• 数据库分析
• 诊断
• 预后

目的:通过研究泛素偶联酶E2C(ubiquitin-conjugating enzyme E2C,UBE2C)在肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)组织中的表达,阐明其对KIRC早期诊断及预后的影响。方法:利用Oncomine、GEPIA数据库和人类蛋白质表达图谱(The Human Protein Atlas,HPA)分析UBE2C在KIRC组织中mRNA和蛋白质水平的变化。运用Linked Omics和GEPIA数据库阐述UBE2C表达与KIRC临床病理学参数的相关性及对预后的影响。在String-DB数据库中探索UBE2C基因在细胞信号转导通路中的位置以及与其关系密切的上下游基因。结果:UBE2C的mRNA在KIRC中表达增加,并且与KIRC病理分级、TNM分期呈正相关,且与种族和人种相关(P <0. 05)。我们应用TCGA分析的结果显示:高水平UBE2C是KIRC总生存率和无病生存率不良的独立预后因素(P <0. 01)。IHC结果证实,与正常肾组织相比,KIRC中UBE2C的蛋白表达量显著升高(P <0. 05)。与UBE2C相关的蛋白有ANAPC10、ANAPC11、ANAPC2、ANAPC4、ANAPC5、AURKA、AURKB、CCNB1等,可能参与细胞周期检查点及蛋白泛素化等细胞功能。结论:通过TCGA数据库信息挖掘发现,UBE2C在KIRC组织中呈高表达,且与患者生存期有关,将为后续的肾癌研究提供重要的理论依据。

• 单位
  西安交通大学第一附属医院