景宁木兰PIF转录因子的生物信息学分析及极端遮阴条件下的表达模式

作者：陆丹迎; 程少禹; 章颖佳; 刘志高; 金梦婷; 董彬; 张寿洲; 彭豪; 戴梦怡; 王卓为; 赵宏波; 申亚梅^*

来源：浙江农林大学学报, 2021, 38(03): 445-454.

DOI：10.11833/j.issn.2095-0756.20200488

• 景宁木兰
• 极端遮阴
• PIF转录因子家族
• 生物信息学分析
• 表达模式

【目的】群落所造成的遮阴是导致景宁木兰Magnolia sinostellata濒危的重要因素之一。PIF家族转录因子在光信号传导和植物生长发育中起到重要作用。对PIF家族转录因子进行系统分析和研究,为探究其在景宁木兰光信号转导机制中的作用奠定基础。【方法】从景宁木兰转录组数据中鉴定获得PIF家族转录因子并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术对其在极端遮阴条件下的表达模式进行分析。【结果】从景宁木兰转录组中共筛选出9个MsPIFs转录因子基因,其编码的蛋白质长度为188～735个氨基酸,蛋白质大小为20 314.56～78 957.02 Da,理论等电点范围为5.18～8.22。MsPIFs基因编码的蛋白质均为不稳定蛋白质,所有蛋白质均为亲水性蛋白质。亚细胞定位预测结果显示所有蛋白质均定位于细胞核。9个蛋白质均具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Try)磷酸化位点。qRT-PCR结果表明:极端遮阴条件下,9个MsPIFs家族基因表达均发生不同程度的变化。其中,MsbHLH23的表达变化较其他基因更为明显,遮阴处理5和10 d时的表达量分别上调为对照的52.77与20.03倍。【结论】景宁木兰PIF转录因子家族均能响应遮阴,为后续对MsPIFs进行生物学功能鉴定奠定了基础。图7表3参32

• 单位
  中国科学院; 浙江农林大学