唇形科常见药用植物DNA条形码的鉴定研究

作者：杨鹏; 沈文华; 石建明; 陈兴银; 张凯凯; 关萍

来源：中草药, 2017, 48(07): 1397-1402.

• 唇形科
• DNA条形码
• ITS
• matK
• 遗传距离

目的筛选出适合唇形科常见药用植物的DNA条形码序列。方法通过对33种唇形科常见药用植物的核糖体ITS序列和40种唇形科常见药用植物的叶绿体matK基因进行PCR扩增和测序,用MEGA 6.0软件计算其种间、种内的Kimura2-parameter(K2P)距离及各序列变异位点,评估序列的条形码间距(barcoding gap),采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统聚类树。结果 ITS序列长度为620～698 bp,平均(G+C)量为62.8%,叶绿体matK基因序列长度为859～932 bp,平均(G+C)量为34%,ITS序列与matK基因都有明显的barcoding gap,但matK基因的barcoding gap要小于ITS序列,从聚类分析来看,matK基因能更好地鉴定唇形科不同物种。结论推荐matK基因序列作为唇形科植物鉴定的优选序列之一。

• 单位
  西南大学; 贵州大学; 家蚕基因组生物学国家重点实验室; 生命科学学院