草酸青霉线性五肽生物合成的比较转录组分析

作者：刘超; 宋瑾怡; 薛艳红; 熊泽; 刘士平

来源：食品与生物技术学报, 2021, 40(05): 37-44.

DOI：10.3969/j.issn.1673-1689.2021.05.005

• 草酸青霉
• 线性五肽
• 生物合成
• 比较转录组
• 基因簇

草酸青霉（Penicillium oxalicum）是一种重要的植物生防菌,从三峡河岸带分布的草酸青霉中,分离到一种线性五肽,该物质对柑橘致腐菌指状青霉（P. digitatum）具有极强的抑制作用。为了分析该五肽的生物合成机制,本研究采用BGISEQ-500平台,测定了3株不同五肽含量的草酸青霉（114-2,SG-4,SJ-3）cDNA文库,并使用参考基因组对序列进行了比较。高通量测序结果表明,3株草酸青霉平均产出了6.55 GB的序列数据,与有参转录组的平均比对率达到91.65%。差异表达基因比较分析表明,相较于不产五肽的114-2,在生产五肽的SG-4和SJ-3中,共有1 648个基因上调表达,1 251个基因下调表达。AntiSMASH分析表明,在草酸青霉基因组中可能存在33个非核糖体肽合成酶（NRPS）,其中15个NRPS的表达与五肽物质的变化趋势一致。进一步的RT-PCR表达分析表明,基因簇PDE01071可能是负责五肽合成的基因簇。