异养硝化菌Acinetobacter harbinensis HITLi 7T冷休克蛋白基因生物信息学分析与不同温度下的表达

作者：马银鹏; 李伟光; 孟利强; 姜威; 张淑梅^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(09): 4003-4009.

DOI：10.13417/j.gab.039.004003

• T" name="keyword">Acinetobacter harbinensis HITLi 7T
• 冷休克蛋白基因
• 生物信息学分析
• 荧光定量PCR

Acinetobacter harbinensis HITLi 7T是一株低温氨氮去除能力较强的异养硝化细菌,在其基因组信息中发现一个冷休克蛋白基因SE27RS01265,基因全长624 bp,编码207个氨基酸。系统发育分析发现,该蛋白与Acinetobacter属菌株的冷休克蛋白同源性为64.73%～82.13%,与菌株A. kookii (GenBank No:WP092820441)同源性最高。预测该蛋白分子量为23.68 kD,没有信号肽,是非分泌型的不稳定碱性疏水蛋白;二级结构主要由Alpha螺旋、延伸链、Beta转角和无规则卷曲等四部分组成。荧光定量PCR研究发现,该基因在低温条件下高表达,在12.5℃相对表达量最高。本研究为解析冷休克蛋白在菌株HITLi 7T低温生长与氨氮去除中的作用提供理论基础。

• 单位
  黑龙江省科学院微生物研究所; 哈尔滨工业大学