北京市29例新确证HIV-1感染者多区段序列病毒亚型分析

作者：宋川; 陈丹瑛; 杜鹏程; 韩俊燕; 张媛媛

来源：实用预防医学, 2016, 23(11): 1315-1318.

• 男男性行为人群
• HIV-1
• 基因测序
• 系统进化树
• 亚型特征

目的了解北京市男男性行为人群(MSM)中,29例新确证HIV-1感染者病毒株的基因序列特征。方法对HIV-1感染者进行流行病学调查,采集全血,分离血浆提取病毒核酸,应用套式反转录聚合酶链式反应(nested reverse transcription-polymerase chain reaction,nested RT-PCR)分别扩增gag、env和pol基因的部分片段,并对扩增产物进行测序,用Mega 5.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据基因序列离散度确定系统进化树,综合三个区域的分型结果分析基因型及其特征。结果分析样本中扩增阳性的基因序列,结果表明至少存在5种不同的HIV-1亚型和重组模式,包括3种常见CRF01AE(48.4%),CRF07/08BC(24.1%),B/B’亚型(10.3%),以及罕见重组型CRF01AE/CRF07BC(6.9%)和CRF01AE/B(10.3%);V3环顶端四肽分析发现,共有五种类型的顶端四肽:GPGQ、GPGR、GPGG、GPGL和GPGP,主要以GPGQ为主(73.3%);辅助受体分析结果发现,CRF01AE亚型和CRF01AE/B亚型的样本中出现了预测为X4嗜性的毒株。结论北京地区MSM人群中29例HIV-1感染者病毒株遗传多样性高,来源复杂,且存在罕见CRF01AE/CRF07BC和CRF01AE/B重组型,应当继续加强HIV-1分子流行病学特征的监测。

• 单位
  首都医科大学附属北京地坛医院