酿酒酵母PDR10基因生物信息学分析

作者：张智铭; 高林; 尹拓; 刘小珍; 张汉尧^*

来源：新疆农业大学学报, 2021, 44(04): 263-269.

• 酿酒酵母
• PDR10
• ABC转运蛋白
• 生物信息学分析

PDR10基因编码一种脂膜蛋白,对质膜的建立和维持具有调节作用。但目前对该基因的生物信息学分析未见相关报道,对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)PDR10基因进行生物信息学分析能够进一步了解该基因的功能及所表达蛋白的功能。通过电子克隆获得PDR10基因序列,再对该基因进行染色体定位和系统进化树分析,使用ExPASy、ProtParam等在线分析工具对该基因所编码蛋白质进行理化性质分析及一、二、三预测分析。PDR10基因全长469 5 bp,位于XV染色体931803-936497;编码蛋白分子式为C7974H12265N2017O2319S69,共156 4个氨基酸,为亲水性蛋白;编码的蛋白质亚细胞定位在质膜上;存在明显的卷曲螺旋区域,不存在信号肽,存在跨膜结构;蛋白质二级结构预测结果显示α-螺旋和随机卷曲是主要元件,β-转角与延伸链占比较少;Motif搜索与结构域分析中均发现存在ABC transporter(ABC运输蛋白)类转录因子,可以初步认为该基因与细胞的物质运输有关。对酿酒酵母PDR10基因生物信息学分析,能够进一步了解其结构及功能,对ABC转运蛋白家族基因功能进行补充,能够为后期研究质膜的建立与维持做铺垫并提供相应资料。

• 单位
  西南林业大学