菠萝蜜AhSS2基因克隆及生物信息学预测

作者：薛亚茹; 李莹; 李映志^*

来源：热带农业科学, 2021, 41(12): 89-95.

• 菠萝蜜
• 蔗糖合成酶
• 生物信息学
• 系统进化分析

蔗糖合成酶(sucrose synthase, SS)作为催化蔗糖代谢的关键酶之一,能够参与蔗糖的代谢和运输,调节细胞分化与细胞壁的形成,对调控作物的品质和产量也有重要作用。克隆出菠萝蜜AhSS2基因并对其进行生物信息学分析。菠萝蜜AhSS2基因的开放阅读框(open reading frame, ORF)全长2 436 bp,共编码811个氨基酸,其蛋白理化性质预测显示,相对分子量是92.583 ku,等电点pI为5.77,属亲水性酸性蛋白质,二级结构主要为Alpha helix (α-螺旋)。保守结构域分析显示,菠萝蜜AhSS2基因属于PLN00142超级家族成员,主要包括蔗糖合成酶结构域(Sucrosesynth)与糖基转移酶结构域(Glycostransf1) 2个保守结构域。磷酸化位点预测显示,菠萝蜜AhSS2基因蛋白的磷酸化位点主要是丝氨酸(Ser)磷酸化位点。系统发育树分析显示,菠萝蜜AhSS2基因在分类上属SSⅡ。本研究为进一步研究菠萝蜜蔗糖合成酶家族成员的功能提供依据。

• 单位
  广东海洋大学