太行鸡MC1R基因的克隆测序、表达及生物信息学分析

作者：范业锴; 王鹏; 周祖阳; 韩海银; 刘玉芳^*

来源：中国家禽, 2021, 43(11): 1-6.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2021.11.001

• 太行鸡
• MC1R基因
• 表达分析
• 生物信息学
• 羽色

为研究影响太行鸡不同羽色性状的重要候选基因MC1R的表达及生物信息学特性,试验以太行鸡麻、白两种羽色为研究对象,采用PCR克隆、实时荧光定量PCR技术和生物信息学分析进行探讨。测序结果显示:太行鸡MC1R基因CDS序列为945 bp,编码蛋白为314个氨基酸;蛋白理化性质分析发现,MC1R蛋白存在7个跨膜区,为跨膜受体;CDS区序列比对发现,太行鸡MC1R基因存在c.637C>T的突变,突变造成编码氨基酸mRNA二级结构和编码蛋白空间结构发生改变;实时荧光定量PCR检测发现,太行鸡麻羽品系毛囊中MC1R的表达量极显著高于白羽品系(P<0.01)。研究结果表明:MC1R基因的c.637C>T突变显著影响太行鸡的羽色,可以作为太行鸡羽色选育的候选分子标记。

• 单位
  生命科学与食品工程学院; 河北工程大学