星星草热激转录因子家族的鉴定及生物信息学分析

作者：李建民; 马家冀; 潘凌云; 付畅^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(08): 2598-2607.

DOI：10.13271/j.mpb.021.002598

• 星星草(Puccinellia tenuiflora)
• 热激转录因子
• 进化分析
• 生物信息学
• 抗逆

热激转录因子(heat shock transcription factors, HSFs)通过调控热激蛋白基因，对非生物胁迫及激素产生积极响应。本研究利用生物信息学方法在基因组范围内系统分析了星星草HSFs家族成员的分类、基本理化性质、进化关系、亚细胞定位及启动子元件。在星星草全基因组序列中共获取了22个HSFs基因。HSFs蛋白长度在273～482个氨基酸之间，分子量在26.91～51.08 kD之间，等电点在4.92～8.56之间；星星草HSFs分布在除2号染色体之外的其他六条染色体上；星星草HSFs蛋白主要定位在细胞核中。聚类分析表明星星草HSFs分为A、B、C三类，每一类中各亚类的HSFs均与水稻HSFs具有较高同源性，每个亚类内部的保守基序种类及排列顺序具有相同或者相似性；星星草HSFs启动子区含有大量响应激素及胁迫的元件。本研究为星星草HSFs基因的进一步功能分析和在抗逆分子育种中的应用提供参考信息。

• 单位
  哈尔滨师范大学