Oncomine数据库的申请及基因信息挖掘

作者：李瑞华; 田国祥; 郭晓娟; 李豹; 张军; 吕军^*

来源：中国循证心血管医学杂志, 2019, 11(07): 774-777.

• Oncomine数据库
• 基因信息
• 肿瘤

近年来,蛋白组学、转录组学、高通量测序技术得到飞速发展,在肿瘤研究领域产生了大量的基因组学数据。Oncomine数据库是目前最丰富的癌基因芯片数据库,也是肿瘤研究领域中的经典数据库。Oncomine数据库可进行癌基因信息的整合数据挖掘,可分析肿瘤组织和正常组织中的差异表达基因,进行基因共表达分析及靶基因与肿瘤临床指标的相关性分析等,直接生成可视化图片结果,其高效能的分析能力和大量储存样本保证分析结果具有极大的参考价值。Oncomine数据库对广大研究者开放,本文旨在对该数据库的申请方式及基因信息挖掘方法进行介绍。

• 单位
  公共卫生学院; 西安交通大学; 解放军总医院; 西安交通大学第一附属医院; 神经内科