长链非编码RNA LOC441178在口腔鳞癌中的生物信息学分析

作者：覃美娇; 甘彬良; 陈昕妤; 吴文玲; 颜诗白; 蓝东; 胡晓桦^*

来源：广西医科大学学报, 2019, 36(05): 797-803.

DOI：10.16190/j.cnki.45-1211/r.2019.05.028

• 口腔鳞状细胞癌
• LOC441178
• 公共数据库
• 生物信息学

目的:通过生物信息学方法分析长链非编码RNA 441178(lncRNA,LOC441178)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达意义及预测其潜在生物学功能机制。方法:利用公共数据库收集LOC441178在OSCC中的表达数据,综合分析LOC441178表达水平与OSCC临床病理特征的关系。使用DAVID 6.8生物信息学工具对LOC441178相关基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,预测LOC441178潜在的作用机制。结果:共纳入13篇文献,包括653个OSCC样本和262个对照样本。LOC441178在OSCC组织中的表达水平显著低于对照组(SMD=-1.60),并对OSCC的诊断价值较高(AUC=0.93)。GEO数据集显示LOC441178与285个基因存在相关性。GO分析显示LOC441178可能影响脂肪酸代谢功能。KEGG分析表明,LOC441178可能通过ABC转运蛋白、丙酮酸代谢、脂肪酸降解等信号通路参与OSCC进程。结论:LOC441178在OSCC组织中的表达水平显著下调,可能通过调节脂肪酸代谢在OSCC发展过程中发挥重要作用。

• 单位
  广西医科大学第一附属医院