中国东北地区人乳头瘤病毒31基因多态性分析

作者：于淼; 吴思; 王爽; 崔畅婉; 路一平; 孙峥嵘^*

来源：中国医科大学学报, 2021, 50(12): 1086-1092.

• 人乳头瘤病毒31
• E6基因
• E7基因
• 基因多态性
• 宫颈癌

目的研究中国东北地区人乳头瘤病毒31 (HPV31) E6和HPV31 E7基因多态性。方法首先将从已确诊HPV31阳性患者宫颈细胞中提取的DNA,应用巢式PCR对E6和E7基因片段进行扩增并测序,再与参考序列比对找到突变位点。应用MegaX软件进行序列比对以及系统发育树的构建,应用PAML软件分析点突变中的正向选择位点,应用PSIPred server预测HPV31 E6和E7蛋白质二级结构,应用ABCPred server寻找理想的B细胞免疫表位,应用ProPred-Ⅰserver和ProPred server分别预测人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ类和HLAⅡ类结合表位。结果成功扩增和测序HPV31 E6和E7序列各151个。与参考序列(J04353.1)比对后发现,E6基因中检测到单核苷酸突变25个,E7基因中检测到单核苷酸突变8个。系统发育分析显示,中国东北地区HPV31 E6和E7基因均以A谱系最为流行。研究观测到的大部分非同义突变存在于预测表位中。结论 HPV31 E6和E7基因组在东北地区呈基因多态性分布,并以A谱系为主。

• 单位
  中国医科大学附属盛京医院