摘要
α-淀粉酶作为一种重要的淀粉分解酶,广泛分布在各种动植物和微生物中,能够促进其生长发育。为了解毛竹α-淀粉酶基因家族生物信息学特征,运用隐马尔可夫方法对毛竹转录组数据进行检索,并验证蛋白的功能结构域,最终得到19条α-淀粉酶蛋白家族成员。通过生物信息学相关分析,结果表明19个成员均为亲水性蛋白,且不均匀的分布在不同染色体上,通过物种间共线性分析表明毛竹与水稻α-淀粉酶的亲缘性大于拟南芥。OsAMY23与PeAMY8、OsAMY24与PeAMY19基因亲缘关系较近,表明其功能较为相近。亚细胞定位显示大多数基因位于能量供应的主要场所线粒体上,推测这些基因与为毛竹生长过程中能量转化相关。毛竹启动子上有较多的光响应元件,可能与毛竹生长中高效的光合作用有关。这些生物信息学结果可以为毛竹的快速生长后续研究提供参考。
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