一株新型肺炎克雷伯菌裂解性噬菌体Pdz533的生物学特性及全基因组分析

作者：张改; 靳静^*; 王山梅^*; 陈松建; 王书伟; 李振江; 刘肖; 李亚辉; 王中全

来源：中国病原生物学杂志, 2023, 18(11): 1303-1310.

DOI：10.13350/j.cjpb.231112

• 肺炎克雷伯菌
• 噬菌体
• 生物学特性
• 全基因组分析

目的 分析1株新型可裂解高黏液表型肺炎克雷伯菌及耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的噬菌体Pdz533的生物学特性及全基因组信息。方法 以留置导尿管尿液中的肺炎克雷伯菌Fb533为宿主菌，从市政污水中分离噬菌体Pdz533,观察其噬菌斑形态，电镜下观察噬菌体的形态结构；分析其噬菌谱、一步生长曲线以及理化稳定性。应用蛋白酶K/SDS法提取噬菌体Pdz533全基因组，对其进行全基因组测序、拼装；对全基因组中可能存在的开放读码框进行预测；基于其保守蛋白构建进化树，进行比较基因组学分析。结果 分离的Pdz533可裂解耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌及高黏液表型肺炎克雷伯菌，该噬菌体在宿主菌Fb533菌苔上形成直径5～8 mm的透明噬菌斑，外周有宽1 mm的半透明晕环。电镜观察Pdz533具有二十面体头部和较短的非收缩性尾部。一步生长曲线显示Pdz533感染Fb533的潜伏期约10 min,裂解量约40 PFU/cell。Pdz533在一个较宽的pH范围内(6～10)和较高的温度下(50℃)活性仍能保持稳定。Pdz533基因组全长40 416 bp,(G+C)摩尔百分比含量为52.9%,预测含有50个开放阅读框。噬菌体全基因组共线性分析显示Pdz533与Autographiviridae科Studiervirinae亚科Przondovirus属噬菌体有相似的保守框架。噬菌体保守蛋白进化树表明，Pdz533为Przondovirus属的一个新成员。结论 分离鉴定了1株新的裂解肺炎克雷伯菌噬菌体，为Przondovirus属的一个新成员。该噬菌体具有一定的酸碱耐受和温度耐受性，可望用于预防和治疗具有高黏液表型及耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的感染。

• 单位
  河南医学高等专科学校; 河南省人民医院; 基础医学院; 郑州大学