陆地棉脱水素基因GhDHN1与拟南芥AtCOR47基因的比较

作者：王俊娟; 陆许可; 郭丽雪; 阴祖军; 王德龙; 陈修贵; 王帅; 樊伟丽; 陈超; 叶武威

来源：中国棉花, 2018, 45(05): 13-19.

• 陆地棉
• 拟南芥
• 脱水素基因GhDHN1
• AtCOR47
• 生物信息学

利用生物信息学分析了陆地棉脱水素基因GhDHN1与拟南AtCOR47基因的区别。结果发现,GhDHN1与拟南AtCOR47基因均有2个外显子,1个内含子;不同的是,AtCOR47基因的内含子和外显子均长于GhDHN1基因的。两个基因的内含子均有较高的AT含量,AtCOR47内含中AT的含量更高,两者外显子和内含子的剪接符合GT-AG规则。GhDHN1与AtCOR47基因所编码的蛋白质均为酸性,带负电荷,属于亲水性蛋白质,均属于SKn型脱水素,其氨基酸序列的一致性为45.2%;不同的是,AtCOR47比GhDHN1多一个保守性的K片段;GhDHN1和AtCOR47基因的启动子比较发现,2个基因的启动子中含有相似的响应非生物逆境胁迫的顺式作用元件和激素响应顺式作用元件,而GhDHN1拥有AtCOR47不具有的参与保卫与胁迫响应顺式作用元件TC-rich repeats,AtCOR47拥有GhDHN1不具有的乙烯响应元件。

• 单位
  中国农业科学院棉花研究所; 棉花生物学国家重点实验室; 农业部