近年来,基层农业事业单位分类优化改革取得了显著成效,但是改革后也面临一些困难和问题,特别是财务管理存在诸多问题,影响了基层农业事业单位健康发展,也不利于农业事业的高质量发展。在这种背景形势下,新的《事业单位财务规则》出台,从2022年3月1日起开始施行,这是《政府会计准则制度》实施后,为进一步规范事业单位财务行为而出台更加具体的行为规则。基于此,本文分析了县级基层农业事业单位财务管理存在的问题,剖析了存在问题的原因,并提出了优化对策,以期能提高其财务管理水平。