基于生物信息学分析腹主动脉瘤发病过程的关键基因及互相作用的miRNA研究

作者：徐程; 唐礼江; 刘小伟; 陈晓锋^*

来源：心脑血管病防治, 2023, 23(02): 8-65.

• 腹主动脉瘤
• 生物信息学
• miRNA

目的 使用生物信息学方法，揭示腹主动脉瘤（AAA）发病过程中参与的关键基因，并预测与其互相作用的潜在miRNA。方法 从GEO数据库中获取GSE7084基因芯片集，应用GEO2R在线工具，以|Log2FC|> 2且校正后P <0.05为筛选标准筛选出差异表达基因。通过DAVID数据库对筛选出的差异表达基因进行功能基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析，使用STRING数据库构建蛋白互作网络（PPI）并利用cytohubba插件分析Degree值并筛选出关键基因。最后，使用CyTargeLinke插件用于预测与关键基因相互作用的潜在miRNA。结果 本研究共获得98个上调基因和99个下调基因。并筛选出了10个关键基因（ITGB2、TYROBP、LCP2、PLEK、LILRB2、CD53、RAC2、MMP9、ITGAX和LAPTM5），同时，预测出108个miRNA可能与其中9个基因形成靶向性相互作用网络。结论 筛选关键基因并且预测与之相互作用的miRNA为AAA治疗靶点的研究提供了理论基础，也为研究AAA发病机制提供了新视角。

• 单位
  温州医科大学; 浙江医院